Nad městečkem Cold Rock v USA se vznáší hrozba: během několika let odtud bez stopy zmizelo několik dětí. Pověrčiví obyvatelé města hovoří o tajemném muži, postavě, která si odnáší děti a nikdy je nevrací zpět. Julia (Jessica Biel) v městečku Cold Rock žije a pracuje jako zdravotní sestra, strašidelnému příběhu nevěnuje pozornost. Jedné noci ji přepadne podivný pocit a když se podívá do synovy dětského pokojíčku, najde jen prázdnou postel. Rychlé seběhne po schodech a zalije ji hrůza: ve dveřích vidí stát Tajemného muže, který v náručí drží jejího syna Davida. Julia se spolehne na svůj mateřský instinkt a pustí se za nimi, nechce o svého syna přijít. Honička začíná as ní se vrací i dávná otázka: kdo je ten Tajemný muž? Co dělá s unesenými dětmi? Film Tajemný muž navazuje na starší snímky M. Night Shyamalana i na tradice filmů, v nichž hrozí nebezpečí hlavním hrdinkám.
